Майже завжди уражуються тільки сходи з насіння. Збудником захворювання є базидіальний гриб Urocystis cepulae Frost, порядку Ustilaginales. Чорна порохувата маса, яка утворюється в місцях уражень, являє собою теліоспори гриба у вигляді спорокупок. Кожна з них складається з однієї, рідше двох-трьох центральних темних клітин і 5-14 периферійних жовтуватих. Темні клітини кулясті або еліптичні, з червоно-цеглястою гладенькою оболонкою, розміром 7-15 мкм у діаметрі. Периферійні клітини не мають протоплазми, їх діаметр 3-7 мкм. Центральні клітини називають плодючими, а периферійні — неплідними.
