Генобанки відіграють важливу роль у довгостроковому збереженні генетичних ресурсів рослин
Генобанки відіграють важливу роль у довгостроковому збереженні генетичних ресурсів рослин для виробництва продовольства та ведення сільського господарства. З 1800 колекцій генобанків по всьому світу понад 600 знаходяться у Європі. Цю величезну різноманітність сільськогосподарських культур можна використовувати, щоб зробити наші культури більш поживними, продуктивними та стійкими до шкідників, хвороб та змін навколишнього середовища, лише якщо у нас є інформація про це.
Європейський каталог пошуку генетичних ресурсів рослин (EURISCO) є міжнародною агрегованою базою даних, яка забезпечує центральну точку входу для інформації про велику генетичну різноманітність сільськогосподарських культур, що зберігається у більш ніж 400 інститутах у 43 європейських та сусідніх країнах.
Оновлена інформація про EURISCO нещодавно була опублікована у спеціальному випуску Nucleic Acids Research (NAR) про біологічні бази даних.
В даний час в EURISCO зареєстровано понад 2 мільйони зразків генетичних ресурсів рослин, включаючи 6737 пологів і 45175 видів. До них відносяться основні зернові культури, такі як пшениця та кукурудза, бобові, такі як квасоля, горох та віка, харчові олійні культури, такі як насіння соняшнику та льону, бульбоплоди, такі як картопля, та культури Brassica.
Більше 400 000 зразків є частиною Багатосторонньої системи доступу та спільного використання вигод (MLS) Міжнародного договору про генетичні ресурси рослин для виробництва продовольства та ведення сільського господарства (ITPGRFA), що означає, що відповідні країни підтвердили їх оперативну доступність відповідно до стандартних та узгоджених на на міжнародному рівні умов спільного використання угод. Крім того, є 2,6 мільйона записів фенотипних даних із більш ніж 3800 експериментів, проведених із матеріалом генбанку.
З моменту першої публікації у випуску бази даних NAR у 2017 році обсяг даних у EURISCO постійно збільшувався: кількість установ, що надають дані, зросла з 376 до 402, кількість задокументованих зразків збільшилася більш ніж на 200 000, а кількість фенотипних даних збільшилась на 2,2 млн (500%).
"Це показує, що EURISCO неухильно завойовує визнання як сховище таких даних", - говорить Стефан Вайс, координатор EURISCO. «Крім того, дані про генетичні ресурси рослин постійно підтримуються та розширюються постачальниками даних. Щороку EURISCO оновлюється від 30 до 40 наборів даних національних інвентаризацій, у середньому 350 000–400 000 зразків на рік. Спільно з Європейським кооперативом Program for Plant Genetic Resources (ECPGR), ми організуємо навчальні семінари для підтримки постачальників даних і, зрештою, для покращення якості даних».
На початку 2022 року інтерфейс користувача EURISCO був повністю перероблений і включає комбінований пошук за паспортними та фенотиповими даними, фасетний пошук, варіанти вибору зразків на основі картки, а також пошукові індекси для наукових назв та загальновживаних назв культур.
У 2023 році EURISCO також проведе розширення, включивши дані про популяції диких родичів сільськогосподарських культур in situ, які є ключовим ресурсом для програм поліпшення сільськогосподарських культур.
"EURISCO є наріжним каменем європейської інформаційної системи з генетичних ресурсів рослин, і її подальший розвиток і зміцнення є ключовими цілями Стратегії з генетичних ресурсів рослин для Європи", - сказав Лоренцо Маджоні, секретар ECPGR.
Також читайте: