Збудник — дводомний гриб Puccinia hordei (синонім P. simplex), [Ph]. Гриб перезимовує в урединіостадії на озимому ячмені та його падалиці. На озимому ячмені карликова іржа з’являється на сходах, а на ярому — починаючи з фази молочної стиглості зерна. При сильному розвитку карликової іржі на озимому ячмені зимостійкість його різко знижується, а недобір врожаю становить 7%.
