Групи діючих речовин Agrobacterium radiobacter

Назва на англійській мові: 
Agrobacterium tumefaciens.

Опис і значення

Agrobacterium radiobacter - грамнегативна паличка, знайдена в грунті, що містить органічну речовину (ризосфера). Це сапрофітний організм, тобто він використовує мертвий рослинний матеріал для поживних речовин.  A. radiobacter штам k84 використовується для його конкурентної поведінки з близькородинними A. tumefaciens ; причина захворювання жовчовивідних шляхів у рослин. A. radiobacter синтезує і секретує речовину, звану агроцин 84, яка блокує здатність a tumefaciens реплікувати свою ДНК, ефективно зупиняючи його здатність до розмноження.  Штам А. radiobacter J14 корисний у своїй здатності розкладати атразин, сільськогосподарський гербіцид.

Він був визнаний опортуністичним патогеном у людей, хоча і володіє відносно низькою вірулентністю. Вважається, що присутність бактерій у людей є нозокоміальним, тобто придбаним в лікарні. Випадки інфекції Agrobacterium найчастіше виникали у зв'язку з наявністю катетера або імплантату кришталика. A. radiobacter також був причиною одного випадку псевдобактериємії, коли 15 зразків крові були забруднені водою, населеної A. radiobacter , що також вказує на те, що бактерії передаються з лікарні людям. 

Структура генома

Геном a. radiobacter був повністю секвенований методом секвенування. Він містить 7,2 мільйона пар підстав зі складом g + c 59,9%.  Генетичний матеріал організований в одну кругову хромосому, яка містить 4 005 130 пар основ, а також чотири плазміди.

П'ять видів Agrobacterium розділені на підставі їх патогенності по відношенню до рослин. A. radiobacter відрізняється тим, що є єдиним представником роду, у якого немає патогенної схильності до рослин. Це проблематичний метод категоризації, оскільки плазміди, відповідальні за патогенність, легко переносяться серед представників роду. Альтернативна система класифікації ділить Agrobacterium на три біоваріанта, заснованих на організації їх генетичного матеріалу. Біовар I містить дві хромосоми і дві плазміди. Біовар III містить дві хромосоми і п'ять плазмід. Біовар II, до якого належить A. radiobacter , містить тільки одну хромосому і чотири плазміди.

Найбільша з плазмід A. radiobacter містить 2650913 пар основ; більше 33% від загального генетичного матеріалу організму і більше, ніж будь-який інший другої хромосоми іншого биварианта. Однак, оскільки він не містить генів, які кодують життєво важливі метаболічні функції, він все ще класифікується як плазміда. Він розділяє значну кількість генів з іншими біоваріантами, які важливі, якщо не життєво важливі, для клітинної функції. Щоб відрізнити його значення, велику плазміду зазвичай називають репликоном. Відомо, що реплікон містить щонайменше один ген, необхідний для виживання клітин.

Структура клітин і колоній

A. radiobacter був вперше виділений з грунту в Австралії . Це палочковидный грамнегативний організм, який сприймає поживні речовини за допомогою хемотаксису і рухається до них, що приводиться в рух перитрихозными джгутиками. A. radiobacter утворює організовані біоплівки в коренях дерев, які він колонізує, виділяючи липку оболонку полісахаридних клітин.  У лабораторних штамів він утворює круглі колонії.

Метаболізм

A. radiobacter є факультативним аеробним гетеротрофом, який не здатний здійснювати ферментацію. Організм використовує мертвий рослинний матеріал в ризосфері, відмінною середовищі, на яку впливають кореневі системи рослин, в якості джерела вуглецю і енергії. Він був культивований в лабораторії з використанням глюкози, фруктози, лактози, мальтози, декстрози, гліцерину, глутамату і сукцинату в якості єдиного джерела вуглецю і енергії. В анаеробних умовах організм здатний використовувати нітрат в якості термінального акцептора електронів.

Під час окисного дихання A. radiobacter запасає енергію у вигляді молекул полиглюкозы в микрокомпартментах. Вони не синтезуються під час анаеробного дихання, яке демонструє підвищену ефективність організму при використанні кисню в якості кінцевого акцептора електронів. Молекули полиглюкозы можуть бути використані різними шляхами біосинтезу, включаючи відновлення хромату. Це корисний процес, тому що хром токсичний для більшості організмів. 

Екологія

A. radiobacter K84 використовується для контролю двох інших представників його роду: A. tumefaciens і A. rhizogenes . Ці два організму викликають захворювання коронного жовчного міхура і волохатих коренів у багатьох видів рослин, корисних для сільського господарства. Захворювання включають перенесення ДНК, званої Т-ДНК, в рослину-господаря. ДНК рослини змінюється таким чином, що він синтезує вуглецеві сполуки, звані опинами, які потім метаболізуються патогенними бактеріями. Бактерії генетично модифікували свою їжу задовго до людини, і механізм, за допомогою якого патогенні Agrobacterium передають свою ДНК рослин, був скопійований для використання в генній інженерії сільськогосподарських культур. 

A. radiobacter K84 містить плазміду (pAgk84), яка кодує синтез агроцина;  Агроцин блокує синтез ферменту Т-РНК-синтетази (LeuRS), який життєво важливий для виробництва білка і, отже, життєздатності клітин. Як биоконтроля агроцин особливо ефективний, оскільки генетичний матеріал, який кодує продукцію патогенної Т-ДНК у A. tumefaciens і A. rhizogenes, також кодує продукцію транспортних білків, які імпортують опины, а це означає, що види, які викликають Захворювання націлені конкретно і ефективно. 

Патологія

Хоча A. radiobacter класифікується за його доброзичливими відносинами з рослинами, нещодавно він був визнаний опортуністичним патогеном серед людей. Випадки зараження A. radiobacter були виявлені у людей з порушеною імунною системою (у хворих раком або ВІЛ), що свідчить про низької вірулентності. Він чутливий до ряду антибіотиків, включаючи цефалоспорини третього покоління, бета-лактами, карбапенеми, Амікацин, ципрофлоксацин, меропенем і ко-тримоксазол. (1) Інфекція найчастіше супроводжує присутність чужорідного матеріалу, такого як катетер або імплантат лінзи що вказує на те, що введення бактерій в організм є внутрішньолікарняними. Більше доказів того, що A. radiobacterинфекция, придбана в стаціонарі, відбувається принаймні з одного відомого випадку псевдобактериемии. Псевдобактериемия - хибнопозитивний результат, заснований на бактеріальному забрудненні зразка.

Ви також можете переглянути на яких культурах (об'єктах) чи проти яких шкідників (хвороб, бур'янів) застосовується дана діюча речовина.

Agrobacterium radiobacter в препаратах

Назва препаратуДіючі речовиниТип препаратуЗаявник (виробник)
(лише перший в списку)
НітроЗлакбактеріальна суспензія Agrobacterium radiobacter, Bacillus megaterium титр життєздатних клітин бактерій – не менше 2,0´109 КУО/мл препаратубіопрепаратиНива, ТОВ СГП ...