Вчені розшифрували геном сої, що сприятиме поліпшенню врожаю в майбутньому
Соя є однією з найважливіших культур, що забезпечує більше половини світового виробництва олії та більше чверті світового білка для харчування людей та кормів для тварин.
Дослідження показали, що соя була одомашнена в Китаї приблизно 5000 років тому, а потім вона поширилася по всьому світу. Під час процесу розповсюдження соя зазнала значних генетичних змін у різних географічних регіонах. Американські вчені розшифрували геном сої для свого регіону в 2008 році (Williams 8). Геном сої, латинська назва якої Glycine max, став одним з найскладніших рослинних геномів, розшифрованих на сьогоднішній день. Його довжина становить близько мільярда пар нуклеотидів - приблизно третина від розміру генома людини.
Азія є однією з найбільших районів посадки і споживання сої. Виробництво сої в цьому регіоні є важливим для забезпечення глобальної продовольчої безпеки. Високоякісний еталонний геном має вирішальне значення для функціонального аналізу виду. Тому розшифрування геному сої азіатських видів стало важливим завданням, щоб сприяти вивченню функціональної геноміки та виведенню елітних сортів.
Біологи з Інституту генетики та біології розвитку Китайської академії наук, Університету науки і техніки Китаю, Академії сільськогосподарських наук та Корпорації ягідної геноміки розшифрували новий геном сої китайського походження "Zhonghuang 13" з послідовністю ДНК.
"Наш остаточно зібраний геном становить 1,025 Гб, контиг N50 - 3,46 МБ, а каркас N50 - 51,87 Мб. Наскільки нам відомо, це четвертий геном сої, який до цього часу розшифрували", - сказав доктор Янтінг Шень, старший автор цієї роботи. "У порівнянні з раніше використовуваним соєвим еталонним геномом, якість нашого нового зібраного геному значно покращується, він має довшу загальну довжину послідовності, вищий контиг N50 та каркас N50 і менше пробілів". Більше того, після ретельного порівняння послідовностей геному між Zhonghuang 13 та Williams 82 дослідницька група встановила, що геном Zhonghuang 13 показує велику кількість генетичних варіацій порівняно з Williams 82. У новому геномі було виявлено в загальній складності 36 429 сполучних елементів та 52 051 ген, що кодує протеїн. Автори сподіваються, що цей новий геном сприятиме дослідженню геноміки бобових та поліпшенню врожаю сої.
Також читайте:
- Вчені: дерева можна модифікувати, щоб вони не поширювали насіння
- Доведено що добрива знижують захисні функції рослин
- В Австралії навчились робити екологічно чисту тканину з кокосових відходів
- Вчені знайшли білок, який захищає рослини від шкідників
- Відкрито грибок, що перетворює комах в «зомбі»
